Daniel Standage
2018-12-20 21:25:59 UTC
samtools tview
を使用して手動で調べたい遺伝子座が多数あります。数十の座標を入力したりコピーアンドペーストしたりするのではなく、パイルアップ「画像」(テキストファイル)の生成を自動化したいと思っていました。
今、いくつかの実験を行ったところ、表示オプション -d H
または -d T
を指定すると、後で検査するために出力をファイルに簡単にリダイレクトできます。しかし、キャプチャしたウィンドウを制御できないようです。ターミナルウィンドウの幅を変更しても、出力は変更されません。また、 -p
フラグ(つまり、 -p chr1:501-700
)も調整されません。いずれにせよ、 tview
は常にテキストモードまたはHTMLモードで80bpウィンドウを報告します。
これを調整する方法はありますか?