Reactomeは、以下にリストされている種ごとに3文字のコードを使用します。

Reactomeで使用される文字コードは標準ですか？

コードを検証して一般名に変換できるWebページまたはダウンロードファイルはありますか？

  HSA Homo sapiens SSC Sus scrofa GGA Gallus gallus DME Drosophila melanogaster RNO Rattus norvegicus DDI Dictyostelium discoideum MMUハツカネズミATHシロイヌナズナTGUTaeniopygia guttataDREダニオレリオOSAオリザサティバBTAボスタウルスXTRゼブラフィッシュCFAカニスファミリアリスSCEサッカロミセスセレビシエPFAプラスモディウムファルシパルムCELカエノラブディティスエレガンスSPO Schizosaccharomyces pombeROTロタウイルスFLUインフルエンザAウイルスHCVC型肝炎ウイルスHBVB型肝炎ウイルスHERヒトヘルペスウイルス1NME Neisseria meningitidis serogroup B NME Neisseria meningitidis CTR Chlamydia lachomatis STY Salmonella typhimurium STY Salmonella enterica ECO CGR Cricetulus griseusHERヒトヘルペスウイルス8MCV Molluscumcontagiosumウイルスサブタイプ1MCV MolluscumcontagiosumウイルスHCYヒトサイトメガロウイルスHIVヒト免疫不全ウイルス1PCH Penicillium chrysogenum
TAE Triticum aestivum VRA Vigna radiatavar。 radiata VRA Vigna radiata CFS Crithidia fasciculata FCA Felis catus AMA Arenicola marina MGA Meleagris gallopavo NGO Neisseria gonorrhoeae SAU Staphylococcus aureusMVIはしかウイルスHALヒトアルファヘルペスウイルス2  

編集

KEGGOrganismsの使用

https://www.genome.jp/kegg-bin/get_htext

文字コードを入力し、例えばGGA

編集- conchoeciaによる answerを読んだ後

Reactomeのグラフデータベーススキーマには、スキーマで省略形という名前の3文字のコードを使用する2つのラベルのみがあります：

種と ReferenceTherapeutic

種には分類群（分類群識別子）があります

 略語taxIddisplayName AMA 6344 Arenicola marina ATH3702シロイヌナズナBAN1392 Bacillus anthracis BTA 9913 Bos taurus CAE 9534 Cercopithecus aethiops CAL 5476 Candida albicans CBO 1491 Clostridium botulinum CEL 6239 Caenorhabditis elegans CFA 9615Canisfamiliari ■CFS5656 Crithidia fasciculata CGR 10029 Cricetulus griseus CPH10703コリネファージベータ
CPO10141赤血球CSBは60711Cercopithecus nigra CTE 1513 Clostridium CTR 813 Chlamydia trachomatis 10610243カウポックスウイルスDDI44689 Dictyostelium DME 7227 Saccharomyces cerevisiae DRE 7955 Anopheles gambiae ECO 562 Escherichia coli FCA 9685 Anopheles gambiae ECO 562 Escherichia coli FCA 9685ヒトアルファヘルペスウイルス2HAM 6706 10310 10407 Homarus americanus HBV Hepat ItisBウイルスHCV11103HCVの100型ウイルス31649100型肝炎ウイルス遺伝子型2HCV31646100型肝炎ウイルスサブタイプ1aHCY10359ヒトサイトメガロウイルスHER10298ヒトヘルペスウイルス1HER37296ヒトヘルペスウイルス8HGA10376ヒトガンマヘルペスウイルス4HIV11676ヒト免疫不全ウイルス1PCNA 333760パピローマウイルス16型HPV337041アルファパピローマウイルス9HSA9606ホモIBR11120感染性気管支炎ウイルスLM1639 Listeria monocytogenes
LMO 1906951 Listeria monocytogenes serovar 1 / 2a LPN 446 Legionella pneumophila MCV 10280 Molluscumcontagiosumウイルスサブタイプ1MCV 10279 MolluscumcontagiosumウイルスMGA9013 Meleagris gallopavo MML 9544 Macaca mulatta MMU 10090 Mus musculus MTU 1773 Mycobacterium 485 Neisseria gonorrhoeae NME 491 Neisseria meningitidis serogroup B NME 487 Neisseria meningitidis OAR 9940 Ovis aries OCU 9986 Oryct olagus cuniculus OSA 4530 Oryza sativa PCH 5076 Penicillium chrysogenum PFA 5833 Plasmodium falciparum RNO 10116 Rattus norvegicus ROT10912ロタウイルスSAU1280黄色ブドウ球菌SCE4932 Saccharomyces cerevisiae SEV 4932 Saccharomyces cerevisiae SEV 11191 Sendai virus SPO 4896 4565 Triticum aestivum
TGO 5811 Toxoplasma gondii TGU 59729 Taeniopygia guttata VRA 3916 Vigna radiatavar。 radiata VRA 157791 Vigna radiata VVI10245ワクチンウイルスXLA8355 Xenopus laevis XTR 8364 Xenopus Tropicalis  

ReferenceTherapeuticはそうではありません。

種は、NCBI分類識別子を使用して識別できます。例：

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?id=6344

編集- user172818

による answerを読んだ後

ファイルの検索 https://www.uniprot.org/docs/speclist.txt for 6344

  AREMA E 6344：N = Arenicola marina C = Lugworm S = Lumbricus marinus コード> 

またはURLを使用： https://www.uniprot.org/taxonomy/6344

そして

データベースは新種の略語の発明をやめるべきだと思います。

ラグワームに関するウィキペディアの記事には、複数のデータベースにある多数の分類群識別子が示されています。