Max Jonatan Karlsson
2017-06-09 20:09:55 UTC
サンプル（1）とサンプル（2）には、これらの内部標準と約30個のペプチドを含む2つの異なる内部標準セットがあります。各ペプチドには、これらの種類の標準のそれぞれの1つがあります。サンプル1から、標準1（S1）と標準2（S2）の真の比率を取得でき、サンプル2から、分析対象物（L）と各標準の比率を取得できます。
サンプル1：S1 / S2
サンプル2：L / S1、L / S2
したがって、サンプル2で測定された比率から比率S1 / S2を計算できます。各サンプルは5回の技術的複製（つまり、LC質量分析計への5回の注入）で実行されるため、特定の1つの分析対象物のS1 / S2比は次のようになります（模擬データ）：
測定計算0 .967 0.9871.007 0.9671.044 1.0121.041 1.0251.048 1.046 測定された比率を計算された比率と比較して、データの取得に偏りがないかどうかを確認したいと思います。計算された比率と測定された比率は異なるサンプルからのものであるため、複製は「リンク」されていないため、たとえばBlandAltman分析を使用できませんでした。ある種のANOVAを使用する必要がありますか？または、他に推奨事項はありますか？
30種類すべてのペプチドの比率を全体的に評価して、ペプチドごとにバイアスが異なるかどうかを確認したいと思います。どうすればよいですか？
どんな入力でも大歓迎です。
こんにちはマックスジョナタンカールソン、あなたの質問に感謝し、バイオインフォマティクススタックエクスチェンジへようこそ。この質問を一目見ただけで、それは純粋な統計の質問である可能性があり、したがって、統計スタック交換、[相互検証済み]（https://stats.stackexchange.com/）でより適切であることがわかります。この質問がコンピュータサイエンスや生物学的知識によって役立つ理由について、より多くのコンテキスト/ストーリーを提供できる場合（たとえば、これらの統計の数千を計算している場合）、質問を更新してください。
ここに投稿したのはプロテオミクスデータだからですが、質問にとって重要ではないと思ったので文脈を取り除いてみました。ただし、これは統計に含まれていることは正しいと思います。そこで質問を投稿し、コンテキストを使用してここで質問を更新します。ありがとう！
コンテキストは、バイオインフォマティクスの質問に常に役立ちます。同様の目的を果たすツールが複数ある場合が多く、問題の性質に応じて最適なツールが変わる可能性があります。コンテキストは、コアの問題が質問と一致しない場合を特定するのにも役立ちます（つまり、[XY問題]（http://xyproblem.info/））。ここではそうではないようですが、将来質問するときは覚えておく価値があります。